Ciao, io ho riscontrato questo problema più o meno una settimana fà, e oggi ho risolto dalla disperazione visto che io ora l'iphone 3GS lo uso come iPod avendo il 4.
Oggi ho risolto cambiando il pezzo dove inserisci il cavetto nel telefono, ed adesso va benissimo. il pezzo di ricambio l'ho montato io da solo visto che faccio questi lavori e adesso ti devo dire che va davvero bene, il PC lo riconosce e il passaggio dei dati è anche più veloce ora..
Se vuoi saperne di più mandami un PM
Se poi così non riesci prova un ripristino di windows oppure una formattazioni nei casi più "disperati"